En los cursos formación bonificada modalidad elearning se utiliza una plataforma online o campus que posibilite la interactividad de participantes, tutores y recursos localizados en diferentes lugares. Esta modalidad comparte algunas características con la modalidad distancia, aunque presenta un entorno virtual de aprendizaje que posibilita la creación de grupos formativos, así como la interacción real y constante entre los participantes y el tutor, y entre los propios participantes. 
Al igual que en la modalidad distancia, deberá existir una Guía Didáctica, Asistencia Tutorial, Controles de Aprendizaje y Recibí de entrega de material, si bien no resultará imprescindible el Recibí si el alumno dispone de toda la documentación a través de la Plataforma, no existiendo por tanto entrega física del material didáctico.
Las actuales plataformas de formación generan registros de interacción con el programa, tanto de la asistencia tutorial como de los controles de aprendizaje, lo que permite el seguimiento del proceso formativo de los participantes. En la modalidad online se solicita URL con objeto de facilitar las labores de seguimiento, el centro gestor de la plataforma de teleformación debe facilitar el acceso telemático a la plataforma utilizada en la ejecución de la acción formativa. También el Usuario y Clave de Acceso con perfil de consultor, que permita verificar los soportes didácticos utilizados en la ejecución de la acción formativa.
En ambas modalidades, las empresas que participan en la Formación Bonificada pueden recibir actuaciones de seguimiento y control del Sepe de un modo In situ y también en la modalidad Ex post, donde se contempla la comprobación de la documentación justificativa de los costes de formación, su contabilización, y el justificante del pago. La entidad organizadora es la responsable de custodiar la documentación relacionada con la organización, gestión e impartición de los cursos en las que intervenga como entidad organizadora, pero las empresas serán directamente responsables de las bonificaciones aplicadas en los seguros sociales.
